Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI70

Mkks, McKusick-Kaufman/Bardet-Biedl syndromes putative chaperonin, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MkksQ9JI70 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MkksQ9JI70 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms