Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW9

Aldh1a3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a3Q9JHW9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms