Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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