Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms