Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Tspan4Q9DCK3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Tspan4Q9DCK3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Tspan4Q9DCK3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Tspan4Q9DCK3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Tspan4Q9DCK3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Tspan4Q9DCK3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Tspan4Q9DCK3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Tspan4Q9DCK3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Tspan4Q9DCK3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Tspan4Q9DCK3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Tspan4Q9DCK3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Tspan4Q9DCK3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan4Q9DCK3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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