Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pop7Q9DCH2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms