Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms