Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9V4

Rsph9, Radial spoke head protein 9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph9Q9D9V4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph9Q9D9V4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph9Q9D9V4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph9Q9D9V4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph9Q9D9V4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph9Q9D9V4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph9Q9D9V4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph9Q9D9V4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph9Q9D9V4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph9Q9D9V4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph9Q9D9V4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Rsph9Q9D9V4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rsph9Q9D9V4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rsph9Q9D9V4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rsph9Q9D9V4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rsph9Q9D9V4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph9Q9D9V4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms