Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V7

Rabl3, Rab-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl3Q9D4V7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabl3Q9D4V7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms