Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D1F3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D1F3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D1F3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D1F3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D1F3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D1F3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D1F3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D1F3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D1F3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D1F3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D1F3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D1F3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D1F3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D1F3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms