Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Zbed3Q9D0L1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
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Zbed3Q9D0L1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbed3Q9D0L1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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