Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PmpcbQ9CXT8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms