Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Khdc3Q9CWU5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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