Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

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Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Atxn3Q9CVD2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Atxn3Q9CVD2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Atxn3Q9CVD2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Atxn3Q9CVD2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atxn3Q9CVD2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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