Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms