Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2a1Q99PM3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms