Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms