Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms