Protein–RNA interactions for Protein: Q99M54

Cdca3, Cell division cycle-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca3Q99M54 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdca3Q99M54 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdca3Q99M54 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdca3Q99M54 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdca3Q99M54 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdca3Q99M54 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdca3Q99M54 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdca3Q99M54 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdca3Q99M54 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdca3Q99M54 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdca3Q99M54 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdca3Q99M54 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdca3Q99M54 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cdca3Q99M54 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cdca3Q99M54 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Cdca3Q99M54 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cdca3Q99M54 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cdca3Q99M54 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Cdca3Q99M54 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms