Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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