Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms