Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Rnf144aQ925F3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Rnf144aQ925F3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Rnf144aQ925F3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Rnf144aQ925F3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Rnf144aQ925F3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Rnf144aQ925F3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.02■□□□□ -0
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Rnf144aQ925F3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Rnf144aQ925F3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.02■□□□□ -0
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Rnf144aQ925F3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Rnf144aQ925F3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Rnf144aQ925F3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Rnf144aQ925F3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Rnf144aQ925F3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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