Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx15Q91WE1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx15Q91WE1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx15Q91WE1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx15Q91WE1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx15Q91WE1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx15Q91WE1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx15Q91WE1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx15Q91WE1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx15Q91WE1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx15Q91WE1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx15Q91WE1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx15Q91WE1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx15Q91WE1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx15Q91WE1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx15Q91WE1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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Snx15Q91WE1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx15Q91WE1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx15Q91WE1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx15Q91WE1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx15Q91WE1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx15Q91WE1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx15Q91WE1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx15Q91WE1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Snx15Q91WE1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx15Q91WE1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx15Q91WE1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx15Q91WE1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx15Q91WE1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx15Q91WE1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx15Q91WE1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx15Q91WE1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx15Q91WE1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx15Q91WE1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx15Q91WE1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx15Q91WE1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx15Q91WE1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx15Q91WE1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx15Q91WE1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx15Q91WE1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx15Q91WE1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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Snx15Q91WE1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx15Q91WE1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx15Q91WE1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx15Q91WE1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx15Q91WE1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx15Q91WE1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx15Q91WE1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Snx15Q91WE1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Snx15Q91WE1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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Snx15Q91WE1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Snx15Q91WE1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx15Q91WE1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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