Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms