Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms