Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms