Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAS9

Parp9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, mousemouse

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Length 866 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp9Q8CAS9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms