Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7N7

Aph1b, Gamma-secretase subunit APH-1B, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1bQ8C7N7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aph1bQ8C7N7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aph1bQ8C7N7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aph1bQ8C7N7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aph1bQ8C7N7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aph1bQ8C7N7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aph1bQ8C7N7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aph1bQ8C7N7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aph1bQ8C7N7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aph1bQ8C7N7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aph1bQ8C7N7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aph1bQ8C7N7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aph1bQ8C7N7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aph1bQ8C7N7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Aph1bQ8C7N7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Aph1bQ8C7N7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aph1bQ8C7N7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aph1bQ8C7N7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aph1bQ8C7N7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aph1bQ8C7N7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aph1bQ8C7N7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aph1bQ8C7N7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aph1bQ8C7N7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aph1bQ8C7N7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aph1bQ8C7N7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aph1bQ8C7N7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aph1bQ8C7N7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aph1bQ8C7N7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aph1bQ8C7N7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aph1bQ8C7N7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Aph1bQ8C7N7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aph1bQ8C7N7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aph1bQ8C7N7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aph1bQ8C7N7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aph1bQ8C7N7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aph1bQ8C7N7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aph1bQ8C7N7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aph1bQ8C7N7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aph1bQ8C7N7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aph1bQ8C7N7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aph1bQ8C7N7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aph1bQ8C7N7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aph1bQ8C7N7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aph1bQ8C7N7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aph1bQ8C7N7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aph1bQ8C7N7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aph1bQ8C7N7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aph1bQ8C7N7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aph1bQ8C7N7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aph1bQ8C7N7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aph1bQ8C7N7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aph1bQ8C7N7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aph1bQ8C7N7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aph1bQ8C7N7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aph1bQ8C7N7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Aph1bQ8C7N7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Aph1bQ8C7N7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Aph1bQ8C7N7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Aph1bQ8C7N7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Aph1bQ8C7N7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Aph1bQ8C7N7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Aph1bQ8C7N7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Aph1bQ8C7N7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Aph1bQ8C7N7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aph1bQ8C7N7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Aph1bQ8C7N7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aph1bQ8C7N7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aph1bQ8C7N7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aph1bQ8C7N7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aph1bQ8C7N7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Aph1bQ8C7N7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aph1bQ8C7N7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Aph1bQ8C7N7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Aph1bQ8C7N7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Aph1bQ8C7N7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aph1bQ8C7N7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aph1bQ8C7N7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aph1bQ8C7N7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Aph1bQ8C7N7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aph1bQ8C7N7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aph1bQ8C7N7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aph1bQ8C7N7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aph1bQ8C7N7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aph1bQ8C7N7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aph1bQ8C7N7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aph1bQ8C7N7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aph1bQ8C7N7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aph1bQ8C7N7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aph1bQ8C7N7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aph1bQ8C7N7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aph1bQ8C7N7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aph1bQ8C7N7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aph1bQ8C7N7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aph1bQ8C7N7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aph1bQ8C7N7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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