Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Atg16l1Q8C0J2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Atg16l1Q8C0J2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Atg16l1Q8C0J2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Atg16l1Q8C0J2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Atg16l1Q8C0J2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Atg16l1Q8C0J2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Atg16l1Q8C0J2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Atg16l1Q8C0J2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Atg16l1Q8C0J2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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