Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ8

Fam53c, Protein FAM53C, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam53cQ8BXQ8 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Fam53cQ8BXQ8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam53cQ8BXQ8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam53cQ8BXQ8 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam53cQ8BXQ8 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam53cQ8BXQ8 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam53cQ8BXQ8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam53cQ8BXQ8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam53cQ8BXQ8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam53cQ8BXQ8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam53cQ8BXQ8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam53cQ8BXQ8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam53cQ8BXQ8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam53cQ8BXQ8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam53cQ8BXQ8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam53cQ8BXQ8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam53cQ8BXQ8 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam53cQ8BXQ8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam53cQ8BXQ8 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam53cQ8BXQ8 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam53cQ8BXQ8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam53cQ8BXQ8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam53cQ8BXQ8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam53cQ8BXQ8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam53cQ8BXQ8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam53cQ8BXQ8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam53cQ8BXQ8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam53cQ8BXQ8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam53cQ8BXQ8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam53cQ8BXQ8 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam53cQ8BXQ8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam53cQ8BXQ8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam53cQ8BXQ8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam53cQ8BXQ8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam53cQ8BXQ8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam53cQ8BXQ8 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam53cQ8BXQ8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam53cQ8BXQ8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam53cQ8BXQ8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
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