Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVP1

Triml1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml1Q8BVP1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Triml1Q8BVP1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Triml1Q8BVP1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Triml1Q8BVP1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Triml1Q8BVP1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Triml1Q8BVP1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Triml1Q8BVP1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Triml1Q8BVP1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Triml1Q8BVP1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Triml1Q8BVP1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Triml1Q8BVP1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Triml1Q8BVP1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Triml1Q8BVP1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Triml1Q8BVP1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Triml1Q8BVP1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Triml1Q8BVP1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Triml1Q8BVP1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Triml1Q8BVP1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Triml1Q8BVP1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Triml1Q8BVP1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Triml1Q8BVP1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Triml1Q8BVP1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Triml1Q8BVP1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Triml1Q8BVP1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Triml1Q8BVP1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Triml1Q8BVP1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Triml1Q8BVP1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Triml1Q8BVP1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Triml1Q8BVP1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Triml1Q8BVP1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Triml1Q8BVP1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Triml1Q8BVP1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Triml1Q8BVP1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Triml1Q8BVP1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Triml1Q8BVP1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Triml1Q8BVP1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Triml1Q8BVP1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Triml1Q8BVP1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Triml1Q8BVP1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Triml1Q8BVP1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms