Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms