Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NischQ80TM9 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
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