Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms