Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms