Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB8

Zcchc2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc2Q69ZB8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 471.2 ms