Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf4Q64287 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms