Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms