Protein–RNA interactions for Protein: Q62217

Sema5a, Semaphorin-5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5aQ62217 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms