Protein–RNA interactions for Protein: Q61818

Rai1, Retinoic acid-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai1Q61818 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rai1Q61818 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rai1Q61818 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rai1Q61818 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms