Protein–RNA interactions for Protein: Q60644

Nr1h2, Oxysterols receptor LXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h2Q60644 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr1h2Q60644 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr1h2Q60644 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr1h2Q60644 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr1h2Q60644 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr1h2Q60644 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr1h2Q60644 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr1h2Q60644 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr1h2Q60644 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr1h2Q60644 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr1h2Q60644 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr1h2Q60644 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr1h2Q60644 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr1h2Q60644 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr1h2Q60644 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr1h2Q60644 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr1h2Q60644 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr1h2Q60644 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr1h2Q60644 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr1h2Q60644 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr1h2Q60644 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms