Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttf2Q5NC05 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms