Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms