Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

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Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Gm26670-201ENSMUST00000180429 3287 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Pcdh15-221ENSMUST00000146682 1891 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Gm43457-201ENSMUST00000200867 2409 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Gm19445-201ENSMUST00000193649 2438 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Mrps14-203ENSMUST00000135680 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SvipQ3UZP4 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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