Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULA2

Btrc, F-box/WD repeat-containing protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BtrcQ3ULA2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BtrcQ3ULA2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms