Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E330014E10RikQ3UL33 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms