Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms