Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Nkx6-3Q3UHX8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Nkx6-3Q3UHX8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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