Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms