Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDP0

Wdr41, WD repeat-containing protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr41Q3UDP0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr41Q3UDP0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr41Q3UDP0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr41Q3UDP0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr41Q3UDP0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr41Q3UDP0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr41Q3UDP0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr41Q3UDP0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr41Q3UDP0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr41Q3UDP0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr41Q3UDP0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr41Q3UDP0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr41Q3UDP0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr41Q3UDP0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr41Q3UDP0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr41Q3UDP0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr41Q3UDP0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Wdr41Q3UDP0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Wdr41Q3UDP0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms